RRC ID 37615
著者 Lowe N, Rees JS, Roote J, Ryder E, Armean IM, Johnson G, Drummond E, Spriggs H, Drummond J, Magbanua JP, Naylor H, Sanson B, Bastock R, Huelsmann S, Trovisco V, Landgraf M, Knowles-Barley S, Armstrong JD, White-Cooper H, Hansen C, Phillips RG, UK Drosophila Protein Trap Screening Consortium, Lilley KS, Russell S, St Johnston D.
タイトル Analysis of the expression patterns, subcellular localisations and interaction partners of Drosophila proteins using a pigP protein trap library.
ジャーナル Development
Abstract Although we now have a wealth of information on the transcription patterns of all the genes in the Drosophila genome, much less is known about the properties of the encoded proteins. To provide information on the expression patterns and subcellular localisations of many proteins in parallel, we have performed a large-scale protein trap screen using a hybrid piggyBac vector carrying an artificial exon encoding yellow fluorescent protein (YFP) and protein affinity tags. From screening 41 million embryos, we recovered 616 verified independent YFP-positive lines representing protein traps in 374 genes, two-thirds of which had not been tagged in previous P element protein trap screens. Over 20 different research groups then characterized the expression patterns of the tagged proteins in a variety of tissues and at several developmental stages. In parallel, we purified many of the tagged proteins from embryos using the affinity tags and identified co-purifying proteins by mass spectrometry. The fly stocks are publicly available through the Kyoto Drosophila Genetics Resource Center. All our data are available via an open access database (Flannotator), which provides comprehensive information on the expression patterns, subcellular localisations and in vivo interaction partners of the trapped proteins. Our resource substantially increases the number of available protein traps in Drosophila and identifies new markers for cellular organelles and structures.
巻・号 141(20)
ページ 3994-4005
公開日 2014-10-1
DOI 10.1242/dev.111054
PII 141/20/3994
PMID 25294943
PMC PMC4197710
MeSH Animals Bacterial Proteins / chemistry Crosses, Genetic Drosophila Proteins / metabolism* Drosophila melanogaster / physiology* Exons Female Gene Expression Profiling* Gene Expression Regulation, Developmental* Genetic Techniques Genome Luminescent Proteins / chemistry Male Membrane Proteins / metabolism* Ovary / metabolism Sex Factors Testis / metabolism Transcription, Genetic
IF 5.611
引用数 57
WOS 分野 DEVELOPMENTAL BIOLOGY
リソース情報
ショウジョウバエ DGRC#115084 DGRC#115085 DGRC#115086 DGRC#115088 DGRC#115089 DGRC#115090 DGRC#115091 DGRC#115092 DGRC#115093 DGRC#115094 DGRC#115095 DGRC#115096 DGRC#115097 DGRC#115098 DGRC#115099 DGRC#115100 DGRC#115101 DGRC#115102 DGRC#115103 DGRC#115104 DGRC#115105 DGRC#115106 DGRC#115107 DGRC#115108 DGRC#115109 DGRC#115110 DGRC#115111 DGRC#115112 DGRC#115113 DGRC#115114 DGRC#115115 DGRC#115116 DGRC#115001 DGRC#115117 DGRC#115118 DGRC#115002 DGRC#115119 DGRC#115003 DGRC#115120 DGRC#115004 DGRC#115121 DGRC#115005 DGRC#115122 DGRC#115006 DGRC#115123 DGRC#115007 DGRC#115124 DGRC#115008 DGRC#115125 DGRC#115126 DGRC#115009 DGRC#115127 DGRC#115010 DGRC#115128 DGRC#115011 DGRC#115012 DGRC#115013 DGRC#115014 DGRC#115015 DGRC#115016 DGRC#115017 DGRC#115018 DGRC#115129 DGRC#115019 DGRC#115130 DGRC#115020 DGRC#115131 DGRC#115021 DGRC#115132 DGRC#115022 DGRC#115133 DGRC#115023 DGRC#115134 DGRC#115024 DGRC#115135 DGRC#115136 DGRC#115025 DGRC#115137 DGRC#115138 DGRC#115026 DGRC#115139 DGRC#115027 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