RRC ID 37616
Author Lye CM, Naylor HW, Sanson B.
Title Subcellular localisations of the CPTI collection of YFP-tagged proteins in Drosophila embryos.
Journal Development
Abstract A key challenge in the post-genomic area is to identify the function of the genes discovered, with many still uncharacterised in all metazoans. A first step is transcription pattern characterisation, for which we now have near whole-genome coverage in Drosophila. However, we have much more limited information about the expression and subcellular localisation of the corresponding proteins. The Cambridge Protein Trap Consortium generated, via piggyBac transposition, over 600 novel YFP-trap proteins tagging just under 400 Drosophila loci. Here, we characterise the subcellular localisations and expression patterns of these insertions, called the CPTI lines, in Drosophila embryos. We have systematically analysed subcellular localisations at cellularisation (stage 5) and recorded expression patterns at stage 5, at mid-embryogenesis (stage 11) and at late embryogenesis (stages 15-17). At stage 5, 31% of the nuclear lines (41) and 26% of the cytoplasmic lines (67) show discrete localisations that provide clues on the function of the protein and markers for organelles or regions, including nucleoli, the nuclear envelope, nuclear speckles, centrosomes, mitochondria, the endoplasmic reticulum, Golgi, lysosomes and peroxisomes. We characterised the membranous/cortical lines (102) throughout stage 5 to 10 during epithelial morphogenesis, documenting their apico-basal position and identifying those secreted in the extracellular space. We identified the tricellular vertices as a specialized membrane domain marked by the integral membrane protein Sidekick. Finally, we categorised the localisation of the membranous/cortical proteins during cytokinesis.
Volume 141(20)
Pages 4006-17
Published 2014-10
DOI 10.1242/dev.111310
PII 141/20/4006
PMID 25294944
PMC PMC4197698
MeSH Animals Bacterial Proteins / chemistry* Cell Nucleus / metabolism Centrosome / metabolism Cytokinesis Cytoplasm / metabolism Drosophila Proteins / metabolism* Drosophila melanogaster / physiology* Gene Expression Profiling Gene Expression Regulation, Developmental* Genetic Techniques Green Fluorescent Proteins / chemistry Luminescent Proteins / chemistry* Mitochondria / metabolism
IF 5.413
Times Cited 13
WOS Category DEVELOPMENTAL BIOLOGY
Resource
Drosophila CPTI collection. DGRC#115001 DGRC#115002 DGRC#115003 DGRC#115004 DGRC#115005 DGRC#115006 DGRC#115007 DGRC#115008 DGRC#115009 DGRC#115010 DGRC#115011 DGRC#115012 DGRC#115013 DGRC#115014 DGRC#115015 DGRC#115016 DGRC#115017 DGRC#115018 DGRC#115019 DGRC#115020 DGRC#115021 DGRC#115022 DGRC#115023 DGRC#115024 DGRC#115025 DGRC#115026 DGRC#115027 DGRC#115028 DGRC#115029 DGRC#115030 DGRC#115031 DGRC#115032 DGRC#115033 DGRC#115034 DGRC#115035 DGRC#115036 DGRC#115037 DGRC#115038 DGRC#115039 DGRC#115040 DGRC#115041 DGRC#115042 DGRC#115043 DGRC#115044 DGRC#115045 DGRC#115046 DGRC#115048 DGRC#115049 DGRC#115050 DGRC#115051 DGRC#115052 DGRC#115053 DGRC#115054 DGRC#115055 DGRC#115056 DGRC#115057 DGRC#115058 DGRC#115059 DGRC#115061 DGRC#115062 DGRC#115063 DGRC#115064 DGRC#115065 DGRC#115066 DGRC#115067 DGRC#115068 DGRC#115069 DGRC#115070 DGRC#115071 DGRC#115072 DGRC#115073 DGRC#115074 DGRC#115075 DGRC#115076 DGRC#115077 DGRC#115078 DGRC#115079 DGRC#115080 DGRC#115081 DGRC#115082 DGRC#115083 DGRC#115084 DGRC#115085 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